Ocho años de crecimiento y creación fueron dañadas o destruidas en sólo quince minutos al final de 1812 Padres Uria y Olbes informó lo siguiente: "21 de diciembre 1812, a eso de las 10 de la mañana, dos terremotos ocurridos en un intervalo . de un cuarto de hora La primera hizo una apertura considerable en la esquina de la iglesia: la segunda crisis arrojó dicha esquina, y una cuarta parte de las viviendas nuevas cayó, demolieron todas las fichas, y abrió una pared principal . Todos ellos siguen siendo útil, sin embargo, si no se producen mayores temblores. "
Por razones de seguridad, una iglesia temporal se erigió fuera del área cuadrilátero. La reconstrucción de los edificios dañados continuó durante los próximos años. Una nueva y más grande iglesia fue construida de adobe y ladrillo y con orientación este. Medía 140 pies de largo, 25 pies de ancho y 30 pies de alto, con paredes de grandes contrafuertes 5 metros de espesor. Maderas de pino pesados traídos de las montañas de San Rafael apoyaron su techo y el techo re-alicatado. La altura del techo fue bajado en la residencia de los frailes, y el techo plano se sustituye por un techo a dos aguas cubierto de tejas. Un nuevo campanario se construyó en este momento. Estos edificios, que se dedicaban el 4 de julio de 1817, siguen siendo hoy en día.